課程介紹
課程內容
生物資訊之醫學 應用
蛋白質體資訊分 析
合成生物學設計
系統生物學
生醫資訊應用實習
微陣列數據分析
合成生物學實作
格網及平行運算
系統生物學實驗
生物資訊實務
七月份課程時刻表
八月份課程時刻表(含9月)
 
格網及平行運算(實驗課程)

學分數:1學分
日期:98年7月4日至98年7月19日止
時間:每星期六、日上午9:10-12:00 下午 13:30- 17:30
教室:圖資大樓401室
負責老師姓名:李國彬

課程說明
本課程介紹高性能電腦在生物資訊上的應用,課程著重在利用平行分散式或格網式電腦。本課程不僅包含 理論基礎介紹,更提供學員硬體軟體實習環境,使學員能得到第一手的操作經驗。課程前段介紹開放原始碼作業系統 Linux 以及如何在 Linux下架設平行運算的軟硬體和程式設計平台。接下來的課程會進入平行化生物序列分析,包含資料庫搜尋, 序列排比,分子演化應用等。本課程也會介紹格網式電腦,包含計算格網和資料格網。在程式開發環境方面,我們會介紹如何在格網式電腦上用工作流程設計軟體自 動建立生物資訊應用程式。

日期

講題

時數

教師姓名

7/4

(六)

Linux OS安裝

3小時

鄧偉華
(國家高速網路中心)

7/4

(六)

Shell Script及Linux指令介紹

3小時

王耀聰
(國家高速網路中心)

7/5

(日)

叢集系統與平行運算簡介

3小時

王耀聰
(國家高速網路中心)

7/5

(日)

平行運算實作(I)

3小時

鄧偉華
(國家高速網路中心)

7/11

(六)

分散式運算與雲端運算簡介

3小時

王耀聰
(國家高速網路中心)

7/11

(六)

平行運算實作(II)

3小時

陳威宇
(國家高速網路中心)

7/12

(日)

參觀國家高速網路與計算中心

3小時

王耀聰
(國家高速網路中心)

7/18

(六)

平行化生物序列分析簡介

3小時

李國彬
(陽明生物醫學資訊所)

7/18

(六)

序列資料庫搜尋

3小時

李國彬
(陽明生物醫學資訊所)

7/19

(日)

序列排比

3小時

李國彬
(陽明生物醫學資訊所)

7/19

(日)

親緣分析

3小時

李國彬
(陽明生物醫學資訊所)

*將視實際情況做稍微變動

2009 陽明大學生物資訊與系統生物學學分班