|
格網及平行運算(實驗課程) |
學分數:1學分
日期:98年7月4日至98年7月19日止
時間:每星期六、日上午9:10-12:00 下午 13:30- 17:30
教室:圖資大樓401室
負責老師姓名:李國彬
|
課程說明 |
本課程介紹高性能電腦在生物資訊上的應用,課程著重在利用平行分散式或格網式電腦。本課程不僅包含
理論基礎介紹,更提供學員硬體軟體實習環境,使學員能得到第一手的操作經驗。課程前段介紹開放原始碼作業系統 Linux 以及如何在
Linux下架設平行運算的軟硬體和程式設計平台。接下來的課程會進入平行化生物序列分析,包含資料庫搜尋,
序列排比,分子演化應用等。本課程也會介紹格網式電腦,包含計算格網和資料格網。在程式開發環境方面,我們會介紹如何在格網式電腦上用工作流程設計軟體自
動建立生物資訊應用程式。 |
日期
|
講題
|
時數
|
教師姓名
|
7/4
|
(六)
|
Linux OS安裝
|
3小時
|
鄧偉華
(國家高速網路中心)
|
7/4
|
(六)
|
Shell Script及Linux指令介紹
|
3小時
|
王耀聰
(國家高速網路中心)
|
7/5
|
(日)
|
叢集系統與平行運算簡介
|
3小時
|
王耀聰
(國家高速網路中心)
|
7/5
|
(日)
|
平行運算實作(I)
|
3小時
|
鄧偉華
(國家高速網路中心)
|
7/11
|
(六)
|
分散式運算與雲端運算簡介
|
3小時
|
王耀聰 (國家高速網路中心)
|
7/11
|
(六)
|
平行運算實作(II)
|
3小時
|
陳威宇
(國家高速網路中心)
|
7/12
|
(日)
|
參觀國家高速網路與計算中心
|
3小時
|
王耀聰
(國家高速網路中心)
|
7/18
|
(六)
|
平行化生物序列分析簡介
|
3小時
|
李國彬
(陽明生物醫學資訊所)
|
7/18
|
(六)
|
序列資料庫搜尋
|
3小時
|
李國彬
(陽明生物醫學資訊所)
|
7/19
|
(日)
|
序列排比
|
3小時
|
李國彬
(陽明生物醫學資訊所)
|
7/19
|
(日)
|
親緣分析
|
3小時
|
李國彬
(陽明生物醫學資訊所)
|
|
*將視實際情況做稍微變動 |
|