Analyses of Resting-State fMRI (Graduate)

Training Course for the Graduate Students (National Cheng Kung University)
Lecturer: Chia-Feng Lu (alvin4016@ym.edu.tw)
靜息態功能性磁振造影分析實作 (碩博班)
授課教師: 盧家鋒

教學目標

本課程為2015年與2016年於成大心智影像研究中心、2017年於北醫大轉譯影像研究中心所舉行之分析訓練課程,目的在介紹fMRI影像之資料形態、常用影像處理步驟以及基本與高階分析之操作講習,實作課程將帶領學員以SPM, REST, GIFT與GraphVar套件進行分析練習。

應用套件

SPM : http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/
IBASPM : http://www.ym.edu.tw/~cflu/software/ibaspm_64.zip
REST: http://restfmri.net/forum/index.php
Mrico : http://www.mccauslandcenter.sc.edu/mricro/index.html
GIFT (v3.0a) group ICA:http://mialab.mrn.org/software/gift/#
Brain Connectivity Toolbox:https://sites.google.com/site/bctnet/
Dynamic Brain Connectome Analysis Toolbox: http://restfmri.net/forum/index.php
GraphVar:http://www.rfmri.org/graphvar/

課程講義NCKU 2015-2016 Training Course

2015年10月3日課程講義活動海報
2015年10月4日課程講義
2016年5月28日課程講義活動海報
2016年5月29日課程講義

範例資料

2015年10月課程使用資料 (基本分析)
2016年5月課程使用資料 (進階分析)

線上課程影片

[2015.10.03 基本rsfMRI分析]靜息態功能性磁振影像分析實作PARTI-1 (1:12:56)
[2015.10.03 基本rsfMRI分析]靜息態功能性磁振影像分析實作PARTI-2 (1:31:22)
[2015.10.04 基本rsfMRI分析]靜息態功能性磁振影像分析實作PARTII-1 (1:33:49)
[2015.10.04 基本rsfMRI分析]靜息態功能性磁振影像分析實作PARTII-2 (55:53)

[2016.5.28 進階rsfMRI分析]Part1/6基本介紹與DICOM (51:11)
[2016.5.28 進階rsfMRI分析]Part2/6 SPM影像前處理與Batch (1:24:47)
[2016.5.28 進階rsfMRI分析]Part3/6 SPM Batch修改 (45:18)
[2016.5.28 進階rsfMRI分析]Part4/6 group ICA與Q&A (1:11:02)
[2016.5.29 進階rsfMRI分析]Part5/6 Seed-based功能性連結 (1:43:32)
[2016.5.29 進階rsfMRI分析]Part6/6複雜網路分析 (1:13:14)

完整播放清單

連結至YouTube

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課程講義 TMU 2017 Training Course

2017年6月16日:Analysis of Fuctional Segregation using REST. 課程講義
2017年6月21日: Analysis of Fuctional Integration/Conectivity using REST. 課程講義,
REST擴充程式碼(FC Strength Map)
使用方式請見講義第30頁
2017年7月14日: Network Analysis of graph topologies using GraphVar. 課程講義
2017年7月24日: Analysis of Dynamic Functional Connectivity and Graphs using GraphVar. 課程講義