分項計畫一: 基因體研究及教學架構之建立
Component
Project 1:
Establishment
of Infrastructure for Genomic Research and Education
分項計畫主持人: 蕭廣仁 教授
Component
Project Coordinator: Prof. Kwang-Jen Hsiao
Phone:
886-2-28757401; Fax: 886-2-28733517
Email:
hsiao@mail.pmf.org.tw
本分項計劃將與本校〈基因體研究中心〉合作,設置下列基因體研究核心設施 (Genomic Research Cores)
- 總辦公室 ----- Coordination Office
- 三個中心 ----- C1: Sequencing Center
C2: Expression Analysis Center
C3: Bioinformatics Center- 五個實驗室 --- L1: Genotyping Lab.
L5: Antibody & Phage Display Lab.
L6: Yeast Genetics Lab.
L7: Protein Analysis Lab.
L8: Protein Production Lab.核酸定序 (C1)基因表現分析 (C2) 及生物資訊 (C3) 為功能基因體 (Functional Genomics) 研究之關鍵所在 (見圖 C-1)。此三個中心所構成之核心扮演下列角色:
(一)、統合其他基因體實驗室 (L1-L11)
(二)、支援主題導向研究 (S1-S5)
(三)、提供教育訓練及國際交流 (E) 之題材基因體核心設施內之運作,一方面透過 genotyping lab (L1)、 molecular cytogenetics lab (L2) 找尋人類染色體目標;另一方面則藉由小鼠系統 (mouse system),開發人類疾病模式與研究題材。功能基因體核心設施所獲得之殖株 (clones) 與資訊將由 molecular pathology lab (L3)、mouse genetics lab (L4)、antibody and phage display lab (L5) 及 yeast genetics lab (L6)作進一步之功能分析或製備出研究材料,以支援 Scientific Program 探討五大主題 -- liver biology and diseases, genetic susceptibility to human diseases, aging, stem cells, drug discovery。為迎接後基因體世代 (post-genome era) 來臨探討基因產物之作用機轉,核心實驗室亦將支援蛋白質之大規模分析 (L7) 與生產 (L8);採用 NMR, X-ray crystallography, molecular modeling 來解析蛋白質之立體結構 (L9);未來亦將引進 cryo-EM 等先進設備分析超分子結構 (supramolecular structure) (L10)。為支援台北醫學院參與研究計劃 (Stem Cell Biology, S5),將於北醫設立 Stem Cell Laboratory (L11),購置流速細胞分析儀 (flowcytometer) 及細胞儲存設備,以推動造血幹原細胞之相關研究。
核心設施所擔負之功能有:
(一) 建立具國際競爭力之基因體與遺傳學研究能力
(二) 支援 Scientific Program 所需之大量核酸及蛋白分析需求
(三) 建立國人相關研究之基本數據
(四) 支援校內外其他研究單位所需大規模之核酸及蛋白分析需求
(五) 提供教育訓練計劃所需之設備、場所、與人力支援
圖 C-1:基因體研究核心設施之組織架構(灰色字體為暫緩實施之設施)
Research
Center
|
Sequencing Center |
Expression Analysis Center |
Bioinformatics Center |
Laboratory
|
Genotyping Lab |
Molecular Cytogenetics Lab |
Molecular Pathology Lab |
Mouse Genetics Lab |
|
Ab & Phage Display Lab |
Yeast Genetics lab |
Protein Analysis Lab |
Protein Production Lab |
|
Sturcture Biology Labs |
Supramolecular Structure lab |
Stem Cell Lab |