一、 目的

        本校積極籌設蛋白體分析中心，積極推動「功能基因體」(functional genomics)的相關教學與研究，以期為我國下一世紀基因生技產業奠基。

二、 背景與緣起

        蛋白體（proteome）指在某一組織或分化細胞內所表現之所有蛋白質，其相關之研究即稱為蛋白體學（proteomics）。由於基因體的研究目前已經迅速進入成熟的階段，全球研發主力早己投向後基因體領域，亦即如何解析基因功能之「功能基因體」領域。在後基因體時代，研究競爭之激烈及其所帶來經濟利益之衝擊，都將是前所未見，而蛋白體學領域被公認是功能基因體研究最重要之環節，因而近兩年迅速發展成為最受注目之研究領域之一。

        蛋白體學的主要研究技術包括利用二維電泳的蛋白質分離分析技術，以及利用質譜儀的微量蛋白質鑑定技術，其相對之應用領域則包括：(1)系統化地鑑定蛋白質及其轉譯後修飾（post-translational modification），以建立不同物種，不同細胞株之蛋白體資料庫。(2)比較分析不同環境條件或刺激下（如疾病、分化、藥物處理等）之蛋白體變化，鑑定出其對應之變化蛋白質，以尋找可能之調控機制，並進而據以開發新型藥物。(3)研究蛋白質分子間交互作用（protein-protein interaction）透過蛋白質複合體成份的確認，以闡明未知蛋白之功能。上述蛋白體學之應用領域仍隨著技術的不斷突破而持續擴展。

        陽明大學與榮民總醫院的研究群過去在生物醫學研究表現卓越，近年更投入基因體研究，並已完成人類第四號染色體的千萬鹼基定序初稿，其研究成果已引起國內學術及產業界密切注目。再加上榮獲教育部兩項卓越計劃，更證明榮陽團隊在生物醫學所投入長年的努力，己經奠立相當雄厚的根基。榮陽團隊立基於過去在基因體研究所獲致之成果，開始策劃建立蛋白體學中心，並結合己設立之生物資訊中心及將成立之結構生物學學程，全力投入後續之功能基因體研究。